蛇妖白素貞受觀音點化，向善千年，終化人形。為紅塵證道，白素貞到人間修行，與臨安城大夫許仙相識。白素貞誤以為許仙是冒充醫仙華佗的騙子，為揭穿他的真面目，她和對方“比拼醫術”，打賭誰先治好長生的母親。白素貞發現長生母親中了蛇毒，追查到女媧廟青蛇妖小青，兩人不打不相識，最終結拜姐妹。
因妖孽作祟，臨安城陸續有孩童失蹤，金山寺和尚法海奉師命前往臨安城捉妖。法海以為作惡的是青白二蛇，追殺二妖。直到元宵節燈會，小長生被擄走，眾人才知道作祟的是蜈蚣精。法海與二妖聯手對付蜈蚣精，二妖的正直令法海對妖的偏見產生了動搖，他決定留在臨安觀察二妖。
許仙與白素貞在相處中，彼此相愛。一直愛慕白素貞的鼠妖景松和傾心許仙的金如意千方百計離間二人感情，但許白二人癡心不改，歷盡磨難後喜結連理。二人開設醫館保和堂，小青也與夥計張玉堂相戀，幾人聯手救死扶傷，造福一方。
法海因開天眼，預見到水漫金山的一幕，擔心二妖是偽善，一切不過是為了蠱惑人心。懷疑之下，他道心動搖，產生心魔。如意看到許白生死相隨的深情，心灰意冷之下被心魔蠱惑，制造兇案嫁禍白蛇。為了保護妻子，許仙求助法海，以純善之身困住心魔，並借助金山寺眾僧之力，與心魔同歸於盡。白素貞不舍許仙犧牲，不惜水漫金山逼法海放人，最終犯下大錯，被鎮壓在雷峰塔下。許仙從此四海為醫，懸壺濟世，替妻贖罪……